Území turistické oblasti Moravský kras a okolí je protkáno hustou sítí cyklotras, stejně tak jako celá jižní Morava. Od severovýchodu směrem k jihu protíná turistickou oblast páteřní cyklotrasa Jantarová stezka a ve stejné trase vede i cyklotrasa Greenway Krakow - Morava – Wien. Jejich délka na území turistické oblasti dosahuje 57 km. Dalšími páteřními cyklotrasami jsou regionální trasy č. 505 (Sloup – Úsobrno - Městečko Trnávka) č. 507 (Ostrov u Macochy - Ždánický les) v celkové délce bezmála 100 km. Místní cyklotrasy dosahují na území turistické oblasti úctyhodných 730 km. Všechny cyklotrasy jsou značeny v terénu.